L’arrachage des tomates, aubergines, poivrons et concombres sous abri est le seul moment où l’on voit les racines, et c’est justement le moment qui compte car il n’existe aucun moyen efficace d’agir en cours de culture contre le corky root ou contre les nématodes à galles. Le bulletin technique bio de la Chambre d’agriculture de Haute-Garonne d’octobre 2026 signale que de plus en plus d’exploitations sont touchées par les nématodes, et recommande de contrôler les racines dans toutes les serres. Regarder le système racinaire de plusieurs plants dans chaque abri avant de sortir les cultures permet de comprendre la saison et d’adapter la suivante.

Les racines qui partent à angle droit viennent de la plantation ou du sol

Quand les racines partent à angle droit dès la sortie de la motte, soit la structure du sol est à revoir, soit la motte a été trop appuyée à la plantation, soit le plant était trop âgé. Un plant resté trop longtemps en pot forme un « chignon » de racines enroulées, avec des symptômes proches d’une asphyxie, c’est-à-dire des racines en partie brunes, une croissance limitée et des jaunissements.

Un système racinaire très superficiel indique plutôt une semelle de travail du sol, difficile à franchir pour l’eau et pour les racines. En cas d’excès d’irrigation elle provoque aussi une asphyxie. Le mini-profil, une fosse ouverte à la bêche à côté d’un pied, montre jusqu’où les racines sont descendues. Si une semelle apparaît, un bon sous-solage permet aux racines d’accéder à des couches de sol neuves, et c’est le travail du sol de la saison suivante qui est à revoir.

Les manchons liégeux sur les racines de tomate sont le signe du corky root

Des racines légèrement brunes ou tachées de brun à noir demandent un diagnostic, et le diagnostic par l’image d’Ephytia aide à le poser. Sur tomate, le corky root (Pyrenochaeta lycopersici) est le plus à craindre. Les radicelles brunissent, se dégradent et disparaissent, puis les grosses racines se couvrent de manchons liégeux, renflés, craquelés et secs, sur le pivot comme sur les racines secondaires.

Ces manchons empêchent les racines de pomper l’eau et les éléments nutritifs, ce qui provoque des carences induites. On les voit sur les feuilles, avec un jaunissement, un plant vert pâle, des nécroses et une tige fine, et sur les fruits avec du cul noir et du collet vert. Le corky root marque les sols fatigués, où la tomate est revenue trop souvent, et dans les parcelles fortement touchées les pertes de rendement vont de 40 à 70 %.

Le greffage ne règle pas le corky root. Les plants greffés sont plus vigoureux, donc l’attaque se voit moins sur la plante alors que le champignon reste dans le sol. Un plant greffé qui a bien produit peut donc avoir des racines liégeuses, et c’est un motif de plus pour les regarder à l’arrachage.

Les renflements sur les racines sont à confirmer avec un technicien

Des galles blanches qui brunissent avec le temps, plus ou moins grosses, signalent des nématodes à galles (Meloidogyne). Pour le confirmer, on coupe une galle en deux et on cherche les femelles adultes, de petites masses rondes blanchâtres. Dans le doute, le bulletin de Haute-Garonne conseille de contacter son technicien pour confirmer.

Ces nématodes s’attaquent à de nombreuses cultures, donc la vérification vaut pour les aubergines, les poivrons et les concombres autant que pour les tomates. La plante pousse moins, son feuillage jaunit, elle flétrit aux heures chaudes et les fruits restent plus petits. Les nématodes préparent aussi le terrain aux champignons telluriques, dont le corky root, si bien que galles et manchons liégeux peuvent se trouver sur la même racine.

Les racines infestées se sortent de l’abri, elles ne s’enfouissent pas

Des plants arrachés avec leurs racines liégeuses ou galleuses enrichissent le sol en champignon ou en nématodes s’ils sont enfouis. Il faut donc les sortir de l’abri et les détruire. Le compost ne suffit pas, car il n’élimine pas totalement les nématodes présents sur les racines. Quand on ne peut pas les sortir, on les laisse à l’air libre au soleil. Les outils de travail du sol et les roues du tracteur se rincent à l’eau avant de passer dans une parcelle saine.

Si des galles ont été vues, une analyse nématologique avant la culture suivante donne le niveau de population du sol, et les mesures se choisissent ensuite en proportion.

La rotation, le couvert et les variétés résistantes ont chacun leurs limites

Contre les nématodes à galles une rotation ne fonctionne qu’à partir de quatre ans au moins, car ils attaquent beaucoup d’espèces et les plantes non hôtes sont peu nombreuses. Ephytia cite l’oignon, l’ail et les céréales d’hiver parmi les moins favorables à leur développement. Pour le corky root la rotation agit surtout avant que le sol soit fortement contaminé, car le champignon se conserve longtemps dans le sol.

En couvert d’hiver sur une parcelle à galles, une céréale d’hiver est moins favorable aux nématodes, alors que la moutarde brune et la roquette se sont montrées plus sensibles aux nématodes que le radis fourrager dans les essais du GRAB. Les mélanges, les doses et les dates de semis sont détaillés dans Semer un engrais vert d’automne.

La résistance des variétés et des porte-greffes vient du gène Mi, efficace sur trois espèces de nématodes à galles (Meloidogyne incognita, arenaria et javanica) mais pas sur Meloidogyne hapla. Elle est contournée à partir de 28 °C, une température que l’on dépasse facilement sous abri en été, et des populations de nématodes qui contournent le gène sont décrites en France. Il vaut mieux ne pas cultiver la même variété ou le même porte-greffe résistant plusieurs années de suite sur la même parcelle.

La solarisation se programme pour l’été prochain

Elle consiste à couvrir un sol bien préparé et bien humidifié avec un film de polyéthylène de 35 à 50 µm, maintenu 4 à 8 semaines en période très ensoleillée, ce qui monte le sol entre 44 et 48 °C, une plage qui élimine bon nombre de nématodes. Pour le corky root, il faut au moins un mois. On la fait après la récolte, et il ne faut pas retravailler le sol trop profondément ensuite, au risque de remonter de la terre non désinfectée. En octobre le soleil ne suffit plus, donc c’est au plan de culture de l’été prochain qu’elle se prévoit.

Sources

• Chambre d’agriculture de Haute-Garonne — BT BIO Légumes, octobre 2026, p. 2 « Transition cultures d’été / d’hiver »
• FRAB AuRA — La lettre technique Maraîchage BIO Auvergne n° 114, octobre 2026, « Observations racinaires à l’arrachage » (lettre reçue par courriel, sans lien public)
• Ephytia, INRAe — Tomate, Pyrenochaeta lycopersici (racines liégeuses) — fiche et méthodes de protection
• Ephytia, INRAe — Tomate, Meloidogyne spp. (galles racinaires), symptômes et méthodes de protection
• Ephytia, INRAe — Tomate, malformations racinaires agronomiques
• GRAB — Maîtrise des ravageurs du sol : nématodes à galles (essais 2008-2012)

Article rédigé pour l’APABA par Clotaire avec une mise en forme assistée par IA. Merci de nous remonter vos retours et observations terrain pour enrichir cette ressource.